200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5894 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 1029 aa  2097    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  35.08 
 
 		 1032 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.53 
 
 		 1029 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 		 906 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.92 
 
 		 1108 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.64 
 
 		 1165 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.07 
 
 		 1114 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.77 
 
 		 1172 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  30.1 
 
 		 1172 aa  125  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  37.38 
 
 		 1223 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  29.79 
 
 		 1180 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  35.08 
 
 		 910 aa  122  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  34.12 
 
 		 1116 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24 
 
 		 1029 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.36 
 
 		 1029 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.36 
 
 		 1029 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.18 
 
 		 1029 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  23.64 
 
 		 1029 aa  107  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.18 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.23 
 
 		 1029 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.04 
 
 		 1018 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  31.17 
 
 		 1081 aa  105  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.42 
 
 		 1029 aa  104  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25 
 
 		 1046 aa  102  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  38.71 
 
 		 953 aa  101  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.11 
 
 		 1029 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.74 
 
 		 961 aa  98.6  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  37.09 
 
 		 881 aa  95.1  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  27.07 
 
 		 1227 aa  95.1  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  46.53 
 
 		 1018 aa  95.1  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  44.55 
 
 		 1018 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  44.55 
 
 		 1018 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  45.54 
 
 		 1018 aa  94.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  44.55 
 
 		 1018 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  44.55 
 
 		 1018 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  44.55 
 
 		 1018 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  24.5 
 
 		 1009 aa  94.4  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.27 
 
 		 851 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  45.54 
 
 		 1018 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  45.54 
 
 		 1018 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  45.54 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  30.94 
 
 		 1230 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  40.15 
 
 		 1234 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  25.47 
 
 		 986 aa  94.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  27.27 
 
 		 1013 aa  94.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.14 
 
 		 1011 aa  94.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 1018 aa  94  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  25.74 
 
 		 1024 aa  93.2  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  41.29 
 
 		 1038 aa  93.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  37.66 
 
 		 1219 aa  91.7  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  38.51 
 
 		 1226 aa  91.3  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  36.99 
 
 		 1223 aa  91.3  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  45 
 
 		 1018 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  40.76 
 
 		 815 aa  90.9  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  28.95 
 
 		 1020 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  32.5 
 
 		 857 aa  89.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  33.54 
 
 		 1047 aa  89  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  47.67 
 
 		 1018 aa  89.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  31.16 
 
 		 995 aa  89  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.05 
 
 		 1020 aa  89  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  28.42 
 
 		 1006 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  38.22 
 
 		 1099 aa  89  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  32.86 
 
 		 1303 aa  88.2  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  36.23 
 
 		 1025 aa  88.2  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  34.3 
 
 		 1346 aa  87.8  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  30.09 
 
 		 1307 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  34.57 
 
 		 962 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  33.12 
 
 		 1224 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  34.27 
 
 		 1009 aa  87  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  34.27 
 
 		 1009 aa  87  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  35.9 
 
 		 1291 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  34.46 
 
 		 1091 aa  86.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  26.44 
 
 		 1046 aa  85.5  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  27.55 
 
 		 1017 aa  84.7  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  26.44 
 
 		 1046 aa  84.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.91 
 
 		 1214 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.11 
 
 		 1223 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  28.11 
 
 		 904 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  25.86 
 
 		 1085 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  32.12 
 
 		 1003 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  45.98 
 
 		 1020 aa  82.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  40 
 
 		 1214 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  33.99 
 
 		 1046 aa  81.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  26.82 
 
 		 1227 aa  81.6  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  24.65 
 
 		 1103 aa  81.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  40.57 
 
 		 1213 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  34.87 
 
 		 1101 aa  80.9  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.36 
 
 		 1023 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  47.22 
 
 		 1058 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  40.57 
 
 		 1211 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  40.57 
 
 		 1211 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  34.78 
 
 		 1022 aa  79.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  39.62 
 
 		 1214 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 		 1214 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 		 1214 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 		 1214 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  28.19 
 
 		 1227 aa  78.2  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.86 
 
 		 1049 aa  78.2  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  36.57 
 
 		 950 aa  77.4  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  35.76 
 
 		 810 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>