More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5778 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  77.11 
 
 		 84 aa  137  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  78.05 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  72.09 
 
 		 87 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 		 85 aa  127  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  69.77 
 
 		 87 aa  126  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  64.13 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  64.04 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 85 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  65.52 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  68.67 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  55.43 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  57.73 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  58.89 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  57.61 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  58.89 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  53.54 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  63.51 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  56.99 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  49.5 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  50.46 
 
 		 100 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  50.5 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  57.3 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  55.91 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  58.51 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  55.68 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  58.89 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  61.9 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  63.41 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  52.08 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  52.08 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>