More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5771 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  100 
 
 		 117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  64.96 
 
 		 117 aa  154  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  63.48 
 
 		 114 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  63.25 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  60.87 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  61.86 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  59.83 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 116 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  58.97 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.89 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  59.29 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.17 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  58.04 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  56.1 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  60.58 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  58.76 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.99 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.62 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  54.29 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  121  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  64 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  56.19 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  58.62 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  57.94 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  59.8 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.05 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  58.65 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  61.22 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.69 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  59.05 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  64.52 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  54.13 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  49.56 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  56.25 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  61.62 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>