213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5769 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  58.62 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  48.28 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  45.45 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  47.46 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  41.82 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 62 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  47.17 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  47.27 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  40 
 
 		 51 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>