More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5713 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  100 
 
 		 1097 aa  2234    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  40.5 
 
 		 1082 aa  762    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  40.29 
 
 		 1090 aa  756    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  31.58 
 
 		 1067 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  29.38 
 
 		 1125 aa  344  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  27.99 
 
 		 1076 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  26.46 
 
 		 1084 aa  290  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.49 
 
 		 1079 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.42 
 
 		 1075 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.83 
 
 		 1167 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  25.84 
 
 		 1117 aa  257  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  26.16 
 
 		 1104 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  24.08 
 
 		 1104 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  22.99 
 
 		 1092 aa  226  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  24.19 
 
 		 1084 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  23.87 
 
 		 1097 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  23.88 
 
 		 1094 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  24.33 
 
 		 1089 aa  217  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  25.18 
 
 		 1016 aa  217  8e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.17 
 
 		 1193 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  22.78 
 
 		 1094 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  23.26 
 
 		 1094 aa  207  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  23.59 
 
 		 1093 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  23.24 
 
 		 1093 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  23.41 
 
 		 1093 aa  201  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  22.64 
 
 		 1094 aa  201  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  22.55 
 
 		 1094 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  22.9 
 
 		 1094 aa  199  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  23.02 
 
 		 1094 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  22.56 
 
 		 1094 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  23.52 
 
 		 1069 aa  191  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1059 aa  180  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  22.27 
 
 		 1065 aa  175  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  24.58 
 
 		 1107 aa  172  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  22.51 
 
 		 1147 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  23.09 
 
 		 1183 aa  145  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  24.83 
 
 		 1181 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1051 aa  122  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  27.22 
 
 		 1010 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.38 
 
 		 1059 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.83 
 
 		 1008 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  28.69 
 
 		 1060 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.7 
 
 		 717 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.44 
 
 		 1066 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.12 
 
 		 1081 aa  115  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  26.75 
 
 		 1069 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.07 
 
 		 1005 aa  112  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  25.47 
 
 		 1186 aa  111  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.17 
 
 		 1138 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  27.1 
 
 		 1062 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.6 
 
 		 1067 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  27.55 
 
 		 1062 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.32 
 
 		 1062 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  27.55 
 
 		 1062 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  27.48 
 
 		 1014 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  27.82 
 
 		 445 aa  102  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  26.67 
 
 		 1062 aa  100  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  26.43 
 
 		 1049 aa  99.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  26.54 
 
 		 1062 aa  98.6  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  25.6 
 
 		 1545 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  26.43 
 
 		 1078 aa  97.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  26 
 
 		 1062 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  25.36 
 
 		 1545 aa  95.5  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.09 
 
 		 1042 aa  95.5  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.91 
 
 		 1040 aa  95.1  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.68 
 
 		 1031 aa  95.1  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.37 
 
 		 1065 aa  94.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.71 
 
 		 1062 aa  94.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1042 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.89 
 
 		 1062 aa  92  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 969 aa  91.3  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.15 
 
 		 1071 aa  90.1  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.63 
 
 		 428 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.47 
 
 		 497 aa  88.6  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.5 
 
 		 1084 aa  87  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  37.28 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  25.68 
 
 		 509 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  23.5 
 
 		 425 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32.97 
 
 		 421 aa  84  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  26.39 
 
 		 774 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  32.47 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.43 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.77 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35.86 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  34.22 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  35.86 
 
 		 434 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  35.81 
 
 		 567 aa  81.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.46 
 
 		 316 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  34.05 
 
 		 425 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  37.33 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  35.14 
 
 		 572 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  35.17 
 
 		 434 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.25 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.14 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 676 aa  79  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.63 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>