65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5614 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  54.62 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  38.08 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  39.53 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  39.53 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  34.93 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  38.34 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  37.45 
 
 		 293 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  38.96 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  34.55 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  33.19 
 
 		 300 aa  141  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  35.63 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  33.85 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  32.06 
 
 		 345 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  31.91 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  33.62 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  29.06 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  29.56 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.89 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  28.64 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  29.13 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  27.59 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  27.14 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  24.42 
 
 		 199 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  27.52 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  27.8 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  25.85 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  26.27 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.73 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  24.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  26.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  26.47 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  27.13 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  28.23 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  25.38 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.53 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  24.35 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  27.61 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  22.94 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  25.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  23.92 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  25.84 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  24.37 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  28.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  25.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  26.83 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.96 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 174 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 201 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.14 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33075  NAD(+) salvage pathway gene  24.67 
 
 		 235 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  28.68 
 
 		 210 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  24.37 
 
 		 208 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  26.57 
 
 		 221 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  29.23 
 
 		 207 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>