More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5540 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  100 
 
 		 601 aa  1197    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  65.52 
 
 		 614 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  50.51 
 
 		 594 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  48.74 
 
 		 596 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  47.41 
 
 		 603 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  47.2 
 
 		 597 aa  551  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  42.76 
 
 		 598 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  42.33 
 
 		 600 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  43.16 
 
 		 601 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.03 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.51 
 
 		 616 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  38.75 
 
 		 586 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.38 
 
 		 641 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.96 
 
 		 632 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  39.17 
 
 		 586 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.47 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 623 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.19 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.62 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 		 619 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.11 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.2 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.58 
 
 		 605 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.92 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.73 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.42 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.45 
 
 		 582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.3 
 
 		 628 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.59 
 
 		 614 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  42.43 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  39.97 
 
 		 594 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.24 
 
 		 629 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.83 
 
 		 597 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  41.88 
 
 		 597 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.78 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  40.1 
 
 		 681 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.95 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.84 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  39.86 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  40.1 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  38.95 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.83 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.48 
 
 		 597 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.75 
 
 		 782 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.31 
 
 		 619 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.13 
 
 		 600 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.95 
 
 		 597 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  39.2 
 
 		 606 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.67 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.28 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.67 
 
 		 616 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.03 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  39.66 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.39 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.31 
 
 		 620 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.24 
 
 		 606 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.65 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.69 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.81 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.13 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  44.19 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.15 
 
 		 634 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  38.4 
 
 		 616 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.73 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.33 
 
 		 644 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.48 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.33 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.33 
 
 		 644 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.52 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.3 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  35.56 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.3 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.02 
 
 		 595 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.25 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.87 
 
 		 578 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0313  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 		 580 aa  368  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.532143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.55 
 
 		 608 aa  369  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.61 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.32 
 
 		 593 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.88 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.31 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.63 
 
 		 595 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.09 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.85 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.91 
 
 		 613 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.1 
 
 		 625 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.03 
 
 		 618 aa  364  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.1 
 
 		 631 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.86 
 
 		 618 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.46 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.67 
 
 		 587 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  39.92 
 
 		 597 aa  359  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  40.08 
 
 		 582 aa  359  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.39 
 
 		 589 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.8 
 
 		 605 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.6 
 
 		 605 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  36.96 
 
 		 618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 571 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  37.29 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>