299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5516 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  44.88 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  38.67 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  39.82 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  38.01 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  32.74 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  38.53 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  35.19 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.62 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.03 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  31.74 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.36 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.4 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  33.63 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.49 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  28.02 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  29.3 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.56 
 
 		 215 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.41 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.18 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.31 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.83 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.36 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  29.34 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  27.88 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.32 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  27.8 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  29.44 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.55 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  29 
 
 		 270 aa  90.1  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.88 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  31.2 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.88 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  28.83 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  29.81 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.68 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.08 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.17 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.74 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.94 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.75 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.52 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.98 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  29.66 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.04 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.31 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.45 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.36 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.93 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  30.45 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  28.19 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  29.23 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.44 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.7 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  27.07 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  30.84 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.03 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.42 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>