More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5495 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  65.66 
 
 
599 aa  831    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.52 
 
 
600 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
610 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  69.63 
 
 
598 aa  872    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  68.8 
 
 
598 aa  857    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  83.28 
 
 
604 aa  1043    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  74.58 
 
 
599 aa  936    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  52.35 
 
 
603 aa  650    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
604 aa  1241    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
602 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
602 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
598 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  71.05 
 
 
601 aa  886    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  69.97 
 
 
604 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  78.61 
 
 
602 aa  983    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 
610 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 
610 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
606 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 
605 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 
611 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 
593 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
603 aa  633  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 
608 aa  631  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 
598 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
614 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 
599 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
610 aa  628  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 
600 aa  625  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 
596 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  53.06 
 
 
600 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.66 
 
 
599 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  51.25 
 
 
604 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.69 
 
 
598 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.61 
 
 
598 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
595 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
616 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.47 
 
 
596 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 
608 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 
603 aa  618  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 
601 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 
601 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
595 aa  616  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
608 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
606 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 
613 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.42 
 
 
598 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 
608 aa  615  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 
596 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 
608 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  51.88 
 
 
597 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
601 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
609 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
604 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 
608 aa  611  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.9 
 
 
610 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.42 
 
 
598 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  51.61 
 
 
598 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 
597 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.18 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  52.13 
 
 
597 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  52.13 
 
 
597 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 
605 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
603 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
606 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 
614 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
602 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51 
 
 
613 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
608 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 
632 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 
608 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
605 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  50.77 
 
 
596 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
614 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 
614 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 
613 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.7 
 
 
600 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 
607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 
614 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.58 
 
 
607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  50.58 
 
 
607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  50.08 
 
 
605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>