45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5466 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  100 
 
 
156 aa  318  1e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  48.39 
 
 
149 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  1.03286e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  37.72 
 
 
170 aa  77.8  6e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  64.7  5e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  31.15 
 
 
164 aa  62.8  2e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  29.03 
 
 
146 aa  61.6  3e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  29.03 
 
 
146 aa  61.6  3e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  61.6  4e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  30.65 
 
 
164 aa  60.8  6e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  6.75932e-09 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  33.58 
 
 
151 aa  60.5  8e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  35.58 
 
 
155 aa  60.5  8e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  59.7  1e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  30.7 
 
 
169 aa  60.1  1e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  35.76 
 
 
157 aa  60.5  1e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  38.94 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.27751e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  26.98 
 
 
142 aa  59.3  2e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.3194e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  36.79 
 
 
139 aa  58.5  3e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  57.8  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  32.17 
 
 
129 aa  57.8  5e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  34.62 
 
 
170 aa  57.4  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  57  9e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  26.06 
 
 
169 aa  56.6  1e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  38.53 
 
 
168 aa  56.6  1e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  57  1e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  31.5 
 
 
155 aa  56.6  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  34.51 
 
 
148 aa  56.6  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  33.91 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  34.56 
 
 
151 aa  55.5  3e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  35.58 
 
 
142 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  33.03 
 
 
142 aa  54.3  7e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  30.97 
 
 
151 aa  53.9  7e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  27.34 
 
 
171 aa  53.9  9e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  33.03 
 
 
142 aa  53.5  1e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  32.72 
 
 
156 aa  53.5  1e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  52.8  2e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  32.56 
 
 
171 aa  52.4  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  30.25 
 
 
157 aa  50.8  8e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.69387e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  42.47 
 
 
143 aa  50.1  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  32.23 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  32.23 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  29.66 
 
 
155 aa  48.9  3e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  29.84 
 
 
153 aa  48.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  46.55 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  6.88301e-10  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  31.45 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>