45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5466 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  48.39 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  37.72 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  31.15 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  29.03 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  29.03 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  30.65 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  35.76 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  30.7 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  26.98 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000023194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  32.17 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  26.06 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  30.07 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  38.53 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  31.5 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  33.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  34.56 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  35.58 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  33.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  30.97 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  27.34 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  33.03 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  32.72 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  32.56 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  30.25 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  42.47 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  32.23 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  32.23 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  29.84 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  46.55 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  31.45 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>