More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5442 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  42.86 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.16 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  41.8 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.14 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.34 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.71 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  39.82 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  45 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.8 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.61 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  50.57 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.87 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  42.31 
 
 
127 aa  66.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.06 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.56 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  37.17 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.71 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  36.84 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.56 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  39.66 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.62 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.92 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.19 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  36.84 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  38.1 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  32.52 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  34.15 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.4 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.4 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.72 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.9 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.47 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  35.96 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  27.5 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>