25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5412 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  44.67 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  37.38 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  42.37 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  45.14 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  39.13 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000253607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  29.81 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  29.84 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 674 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  26.56 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  26.89 
 
 		 423 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1052 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  30.56 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  24.58 
 
 		 441 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 648 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  24.58 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  27.87 
 
 		 668 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 451 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0277  hypothetical protein  25.58 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>