More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5228 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  203  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  31.11 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.44 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  32.18 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  31.11 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  42.47 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 99 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  39.24 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  41.54 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  35.44 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>