More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5203 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
668 aa  1368    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  59.64 
 
 
648 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  37.54 
 
 
656 aa  445  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 
666 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  32.51 
 
 
643 aa  306  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 
650 aa  293  9e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 
653 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 
660 aa  283  6.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.8 
 
 
665 aa  270  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.03 
 
 
677 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.66 
 
 
640 aa  262  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.7 
 
 
626 aa  260  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 
671 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  31.04 
 
 
672 aa  255  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.75 
 
 
645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.45 
 
 
641 aa  250  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.42 
 
 
903 aa  248  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 
631 aa  247  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.44 
 
 
673 aa  240  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
642 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  30.92 
 
 
630 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 
630 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 
658 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 
638 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.79 
 
 
620 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.01 
 
 
679 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 
757 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.48 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  30.84 
 
 
631 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  30.58 
 
 
509 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 
712 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 
798 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.98 
 
 
669 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.63 
 
 
712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  30.67 
 
 
694 aa  154  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 
613 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 
704 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  28.6 
 
 
585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.98 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.35 
 
 
710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.84 
 
 
510 aa  147  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 
813 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.36 
 
 
670 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.01 
 
 
648 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 
778 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  27.15 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.76 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
525 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  47.55 
 
 
568 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 
586 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.88 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 
594 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  35.62 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.42 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.4 
 
 
673 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.46 
 
 
412 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  31.03 
 
 
239 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 
440 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 
432 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  38.6 
 
 
263 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.24 
 
 
466 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
427 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.44 
 
 
375 aa  91.3  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
375 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 
362 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.46 
 
 
320 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.82 
 
 
365 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
388 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
637 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
374 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.16 
 
 
319 aa  87.8  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  38.52 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.18 
 
 
266 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  32.23 
 
 
293 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.74 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 
241 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 
1755 aa  84  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
243 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.52 
 
 
427 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.38 
 
 
478 aa  83.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.96 
 
 
199 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.43 
 
 
1793 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  41.07 
 
 
1313 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
623 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.32 
 
 
230 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.29 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.96 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.24 
 
 
240 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.18 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.33 
 
 
422 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  35.71 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
361 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  33.88 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.23 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>