More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5095 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 334 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  76.95 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  71.21 
 
 		 337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  65.55 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  68.18 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.33 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  60.66 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  62.31 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  62.54 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  61.7 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.01 
 
 		 340 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  58.46 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  54.74 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  54.77 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  52.76 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  54.08 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.66 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.98 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  51.26 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.38 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.88 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  51.88 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.94 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  48.19 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  48.19 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.92 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.41 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.5 
 
 		 427 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.31 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.94 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.23 
 
 		 350 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.57 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.95 
 
 		 482 aa  269  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  45.99 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 338 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  50.79 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  51.03 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  46.95 
 
 		 435 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.95 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.77 
 
 		 463 aa  265  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  46.04 
 
 		 439 aa  265  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.37 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.98 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  48.33 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.37 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  46.42 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.22 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.41 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.64 
 
 		 464 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  49.08 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  44.85 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  51.26 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  49.53 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  48.74 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.31 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  48.46 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  49.83 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  47.16 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.34 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 428 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  44.85 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  46.86 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.78 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.73 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 432 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  45.18 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  50.52 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  46.88 
 
 		 422 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  47.89 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  43.6 
 
 		 407 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 428 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  48.22 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  44.21 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  47.01 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  44.27 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>