48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5088 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.5 
 
 		 204 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  44.66 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.51 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.41 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  39.41 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.32 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  32.68 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 177 aa  98.2  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  32.5 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  32.52 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  31.88 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  29.95 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  29.76 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  26.56 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  36.63 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  36.63 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.26 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.51 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  41.25 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  22.12 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.04 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.94 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 		 133 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  28.36 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  27.69 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.99 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.38 
 
 		 136 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  34.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  31.67 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.73 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.27 
 
 		 135 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  31.51 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.33 
 
 		 136 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  32.26 
 
 		 135 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.54 
 
 		 134 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  25.18 
 
 		 132 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.73 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>