218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5085 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  64.75 
 
 
739 aa  953    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  69.15 
 
 
729 aa  1031    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  67.32 
 
 
751 aa  1027    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  60.11 
 
 
726 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  59.97 
 
 
726 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  74.72 
 
 
727 aa  1091    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  68.37 
 
 
751 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0775  peroxidase/catalase oxidoreductase protein  75.33 
 
 
455 aa  705    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.392915  decreased coverage  0.00378616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  68.78 
 
 
740 aa  1059    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  63.5 
 
 
740 aa  934    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  64.91 
 
 
741 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  61.58 
 
 
728 aa  908    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  72.73 
 
 
756 aa  1122    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  66.67 
 
 
749 aa  988    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  60 
 
 
721 aa  880    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  66.53 
 
 
749 aa  984    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  60.14 
 
 
721 aa  882    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  62.16 
 
 
724 aa  902    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  69.54 
 
 
728 aa  1022    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  71.94 
 
 
756 aa  1110    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  71.2 
 
 
736 aa  1005    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  68.27 
 
 
751 aa  986    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  75.45 
 
 
728 aa  1117    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  69.88 
 
 
729 aa  1009    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  74.63 
 
 
728 aa  1127    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  71.28 
 
 
755 aa  1106    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  72.59 
 
 
739 aa  1095    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  71.64 
 
 
728 aa  1071    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  76.37 
 
 
733 aa  1170    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  60.74 
 
 
729 aa  871    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  60.41 
 
 
720 aa  887    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  74.22 
 
 
728 aa  1126    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  72.95 
 
 
744 aa  1116    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  68.34 
 
 
732 aa  990    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  67.14 
 
 
747 aa  921    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  74.97 
 
 
718 aa  1102    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  61.11 
 
 
735 aa  918    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  61.25 
 
 
738 aa  924    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  69.09 
 
 
732 aa  996    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  76.41 
 
 
731 aa  1170    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  70.57 
 
 
753 aa  1065    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  59.4 
 
 
720 aa  873    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  69.64 
 
 
732 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  58.88 
 
 
717 aa  857    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  68.35 
 
 
729 aa  1011    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  71.29 
 
 
726 aa  1054    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  72.21 
 
 
752 aa  1086    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  68.77 
 
 
738 aa  1028    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  60.43 
 
 
731 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  72.59 
 
 
728 aa  1086    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  72.78 
 
 
728 aa  1070    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  62.25 
 
 
749 aa  927    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  63.73 
 
 
753 aa  920    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  70.84 
 
 
726 aa  1029    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  64.78 
 
 
740 aa  932    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  61.08 
 
 
726 aa  880    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  68.87 
 
 
757 aa  1055    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  62.13 
 
 
728 aa  930    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  64.73 
 
 
739 aa  952    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  65.77 
 
 
739 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  62.13 
 
 
728 aa  917    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  62.07 
 
 
723 aa  901    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  61.12 
 
 
738 aa  889    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  60.62 
 
 
757 aa  851    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  60.7 
 
 
724 aa  861    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  72.48 
 
 
728 aa  1073    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  64.08 
 
 
741 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  72.59 
 
 
728 aa  1086    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  72.78 
 
 
728 aa  1070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  61.99 
 
 
728 aa  903    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  65.42 
 
 
739 aa  968    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  73.81 
 
 
736 aa  1090    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  70.82 
 
 
732 aa  1035    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  59.24 
 
 
725 aa  857    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  65.43 
 
 
760 aa  940    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  65.14 
 
 
738 aa  976    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  59.43 
 
 
718 aa  861    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  62.25 
 
 
749 aa  927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  60.33 
 
 
724 aa  891    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  59.07 
 
 
737 aa  863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  63.73 
 
 
747 aa  929    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  58.65 
 
 
723 aa  854    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  68.14 
 
 
743 aa  1024    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  60.79 
 
 
724 aa  878    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  66.85 
 
 
715 aa  962    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  73.04 
 
 
726 aa  1070    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  61.58 
 
 
728 aa  923    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  72.8 
 
 
721 aa  1087    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  62.25 
 
 
749 aa  927    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  74.49 
 
 
728 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  61.88 
 
 
756 aa  858    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  61.78 
 
 
748 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  62.16 
 
 
724 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  65.4 
 
 
716 aa  934    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  61.52 
 
 
717 aa  868    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>