More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5030 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
172 aa  357  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
174 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  42.86 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  45.45 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
166 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  44.72 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  47.92 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
155 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  40.49 
 
 
154 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  45.75 
 
 
154 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  40.49 
 
 
154 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.49 
 
 
154 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
154 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.88 
 
 
154 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.5 
 
 
453 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.55 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  40.12 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
150 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
159 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 
154 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  40.59 
 
 
158 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
160 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  38.65 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
154 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  38.22 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
152 aa  110  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.38 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  38.99 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 
165 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  39.38 
 
 
162 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
160 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
159 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
159 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
154 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
159 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  37.89 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.1 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
163 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 
159 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
159 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
160 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.26 
 
 
157 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
154 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  41.4 
 
 
157 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  39.2 
 
 
175 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
166 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
151 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  37.13 
 
 
173 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  39.61 
 
 
157 aa  104  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  42.51 
 
 
164 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.46 
 
 
186 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 
165 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  39.51 
 
 
164 aa  102  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.31 
 
 
160 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  36.65 
 
 
155 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
165 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
167 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.41 
 
 
164 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  37.66 
 
 
171 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.51 
 
 
159 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  36.65 
 
 
162 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 
173 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.19 
 
 
186 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>