40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4975 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  53.48 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  50.51 
 
 
402 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  27.45 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  29.45 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  24.92 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  26.22 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  35.94 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  27.39 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  25.08 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  24.62 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  26.17 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  23.54 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  32.43 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  23.5 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  31.1 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  30 
 
 
527 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  27.46 
 
 
528 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  33.12 
 
 
538 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  28.42 
 
 
527 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  26.61 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  25.99 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  26.2 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  32.17 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  24.93 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  24.55 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  33.12 
 
 
426 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  33.12 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  33.12 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  33.12 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  33.12 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  33.12 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  25.25 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  28.05 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  26.39 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  24.24 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42896  predicted protein  23.74 
 
 
600 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  29.38 
 
 
451 aa  43.1  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  26.47 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  23.81 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>