More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4970 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 428 aa  887    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  71.26 
 
 		 424 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  75.18 
 
 		 431 aa  686    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  80.14 
 
 		 433 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  74.11 
 
 		 423 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  69.05 
 
 		 439 aa  622  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  68.88 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 422 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  62.82 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 440 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  61.21 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  61.97 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 438 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  60.86 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 423 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 423 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 415 aa  474  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  55.76 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.08 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.48 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  53.63 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  53.32 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.48 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.14 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  54.14 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  53.43 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  53.52 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>