More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4938 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  37.89 
 
 		 968 aa  639    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  57.09 
 
 		 1113 aa  1249    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1130 aa  2330    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.86 
 
 		 1136 aa  996    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  61.8 
 
 		 1118 aa  1332    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  48.6 
 
 		 1027 aa  938    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  47.49 
 
 		 1031 aa  968    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  41.59 
 
 		 1004 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  70.51 
 
 		 1114 aa  1659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  48.33 
 
 		 1024 aa  940    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  48.48 
 
 		 1017 aa  946    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  42.16 
 
 		 1117 aa  772    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  56.29 
 
 		 1117 aa  1269    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  54.78 
 
 		 1116 aa  1267    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  62.61 
 
 		 1118 aa  1456    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  62.77 
 
 		 1102 aa  1372    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  48.95 
 
 		 1024 aa  953    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.23 
 
 		 1029 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  56.98 
 
 		 1114 aa  1286    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  57.28 
 
 		 1120 aa  1289    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  49.28 
 
 		 1022 aa  934    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  38.36 
 
 		 858 aa  634  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  38.33 
 
 		 896 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  40.9 
 
 		 884 aa  622  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  36.04 
 
 		 862 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  36.22 
 
 		 862 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  36.16 
 
 		 862 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  37.13 
 
 		 848 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  39.93 
 
 		 921 aa  608  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  36.57 
 
 		 910 aa  599  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 917 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.03 
 
 		 1024 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  36.4 
 
 		 1010 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  35.95 
 
 		 910 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.28 
 
 		 992 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  36.42 
 
 		 917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  36.33 
 
 		 917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 		 930 aa  562  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.38 
 
 		 834 aa  475  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  47.05 
 
 		 796 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  46.73 
 
 		 830 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 908 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  45.52 
 
 		 897 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 		 840 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 		 845 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  45.47 
 
 		 840 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  45.33 
 
 		 908 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 		 899 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  45.08 
 
 		 909 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 908 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 908 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  43.4 
 
 		 866 aa  458  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 911 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 908 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 907 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  44.56 
 
 		 908 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 908 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 908 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 		 842 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  41.41 
 
 		 931 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  43.06 
 
 		 902 aa  456  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  41.27 
 
 		 873 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  43.52 
 
 		 859 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  43.67 
 
 		 899 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  45.63 
 
 		 894 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.93 
 
 		 907 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.15 
 
 		 886 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  40.43 
 
 		 912 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  45.77 
 
 		 869 aa  450  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 		 909 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  38.95 
 
 		 907 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  45.28 
 
 		 833 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  46.8 
 
 		 868 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 		 907 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  43.43 
 
 		 907 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  44.56 
 
 		 907 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  45.27 
 
 		 863 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.58 
 
 		 906 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 855 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  41.67 
 
 		 872 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 909 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  42.61 
 
 		 903 aa  446  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  42.98 
 
 		 864 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  42.28 
 
 		 857 aa  446  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  39.72 
 
 		 896 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  45.44 
 
 		 845 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  42.35 
 
 		 935 aa  446  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 906 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  46.44 
 
 		 871 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  41.84 
 
 		 896 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.72 
 
 		 896 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  40.06 
 
 		 903 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 896 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  42.2 
 
 		 917 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  46.63 
 
 		 871 aa  443  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  44.98 
 
 		 908 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  42.74 
 
 		 925 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  39.24 
 
 		 901 aa  442  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  41.98 
 
 		 900 aa  439  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  43.76 
 
 		 896 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>