240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4937 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  100 
 
 		 800 aa  1611    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  43.86 
 
 		 791 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  39.26 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  42.4 
 
 		 812 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 830 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  34.83 
 
 		 824 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 830 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  38.06 
 
 		 846 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 828 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 828 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.37 
 
 		 827 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 837 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 837 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.28 
 
 		 828 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.11 
 
 		 837 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 952 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 948 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.83 
 
 		 781 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 1055 aa  234  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  33.02 
 
 		 936 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 910 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  28.55 
 
 		 912 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.24 
 
 		 920 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 922 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 834 aa  217  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 947 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.39 
 
 		 833 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 919 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 921 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  29.43 
 
 		 931 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.79 
 
 		 915 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.7 
 
 		 920 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 940 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 919 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 977 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  32.44 
 
 		 852 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.3 
 
 		 869 aa  185  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 869 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  28.93 
 
 		 897 aa  178  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 779 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 753 aa  155  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 803 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.88 
 
 		 849 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.08 
 
 		 877 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.23 
 
 		 877 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.16 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.45 
 
 		 875 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.45 
 
 		 800 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.41 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.96 
 
 		 580 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  24.84 
 
 		 478 aa  108  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.94 
 
 		 579 aa  101  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  24.57 
 
 		 609 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 605 aa  97.8  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.92 
 
 		 703 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  23.41 
 
 		 587 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  25.27 
 
 		 603 aa  92  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  22.53 
 
 		 700 aa  91.3  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  30.7 
 
 		 558 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  30.7 
 
 		 558 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  30.7 
 
 		 558 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 537 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  32.99 
 
 		 425 aa  88.6  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.13 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.13 
 
 		 552 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  22.18 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 516 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.66 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.96 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.95 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  30.34 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  24.11 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.13 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.94 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.94 
 
 		 277 aa  72  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  22.9 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  23.15 
 
 		 992 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  23.95 
 
 		 573 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.56 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  23.31 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  27.64 
 
 		 262 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 295 aa  63.9  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 387 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  21.51 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  23.3 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>