More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4927 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 309 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  43.85 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  44 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  43.87 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  44.19 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  44.19 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  44.19 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  43.56 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.33 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  41.64 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.54 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.24 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 1061 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.74 
 
 		 1162 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.69 
 
 		 1161 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 924 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.64 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.7 
 
 		 1099 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.16 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.16 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.12 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.17 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 597 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.22 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.98 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.18 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  22.55 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 637 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 1035 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  20.25 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2110  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 785 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.12 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  22.64 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 576 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  24.17 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  31.4 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>