66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4910 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  46.31 
 
 
212 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  40.8 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  41.5 
 
 
232 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  39.8 
 
 
212 aa  154  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  39.9 
 
 
212 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  39.3 
 
 
219 aa  154  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  39.9 
 
 
212 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.5 
 
 
209 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  43.3 
 
 
210 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  37.19 
 
 
226 aa  150  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  39.69 
 
 
244 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  43.5 
 
 
213 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  42.5 
 
 
211 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  42.27 
 
 
210 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  42.5 
 
 
207 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  37.06 
 
 
220 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  43.3 
 
 
211 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  39.8 
 
 
205 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  39.69 
 
 
251 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37 
 
 
223 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  38.81 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  37.5 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.21 
 
 
233 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  36.73 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  35.64 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  37.04 
 
 
215 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.48 
 
 
227 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  35.38 
 
 
207 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  35.15 
 
 
217 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  35 
 
 
230 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.15 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.78 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  38.5 
 
 
220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.5 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  39.74 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.67 
 
 
207 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  32 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  35.18 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  29.56 
 
 
207 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  29.7 
 
 
224 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  31.47 
 
 
304 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  29.35 
 
 
252 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  51.9 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  32.32 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  33.57 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  36.8 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  42.05 
 
 
324 aa  61.6  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  37.62 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  38.04 
 
 
338 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  31.2 
 
 
326 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  33.72 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  25.93 
 
 
541 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  36.59 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  31.96 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  34.04 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119509  hypothetical protein  36.59 
 
 
519 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>