33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4849 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1390  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  46.66 
 
 
689 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  46.94 
 
 
686 aa  608  1e-172  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  44.94 
 
 
703 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  44 
 
 
670 aa  583  1e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  43.78 
 
 
694 aa  558  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  47.4 
 
 
678 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  43.23 
 
 
686 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  46.04 
 
 
687 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  45.82 
 
 
676 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  43.91 
 
 
679 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  47.18 
 
 
694 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  42.98 
 
 
676 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  43.15 
 
 
676 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  41.12 
 
 
678 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  38.77 
 
 
679 aa  346  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
684 aa  333  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  38.08 
 
 
682 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  4.32292e-07 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  39.21 
 
 
684 aa  313  8e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.52 
 
 
681 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  38.33 
 
 
681 aa  306  1e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  39.25 
 
 
682 aa  305  1e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  5.8517e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  38.17 
 
 
682 aa  294  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.19 
 
 
531 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  32.24 
 
 
508 aa  227  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  29.37 
 
 
469 aa  207  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  33.63 
 
 
473 aa  184  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  28.73 
 
 
470 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  28.81 
 
 
485 aa  174  4e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  27.89 
 
 
485 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  26.74 
 
 
477 aa  157  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  29.79 
 
 
914 aa  84.3  7e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  27.37 
 
 
186 aa  81.6  5e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>