67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4847 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  100 
 
 		 1219 aa  2533    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  32.56 
 
 		 1183 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1182 aa  600  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1174 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1162 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1140 aa  573  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1171 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  32.59 
 
 		 1160 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  31.87 
 
 		 1205 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  30.83 
 
 		 1180 aa  526  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  30.41 
 
 		 1167 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1131 aa  514  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  29.97 
 
 		 1144 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1270 aa  363  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  30.32 
 
 		 612 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1218 aa  252  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1125 aa  249  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1241 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1430 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  30.3 
 
 		 731 aa  181  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1162 aa  180  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.28 
 
 		 706 aa  170  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1154 aa  167  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1154 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1129 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1141 aa  154  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1497 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1359 aa  142  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1107 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  24.14 
 
 		 882 aa  132  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1324 aa  132  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1174 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1425 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1326 aa  89.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.5 
 
 		 950 aa  84.7  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1484 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  23.02 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  26.19 
 
 		 309 aa  64.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.23 
 
 		 974 aa  60.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1178 aa  60.1  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.12 
 
 		 1058 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1177 aa  58.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1195 aa  57.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  38.96 
 
 		 1239 aa  55.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  23.6 
 
 		 288 aa  55.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1120 aa  52  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.67 
 
 		 995 aa  51.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  41.54 
 
 		 746 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1231 aa  50.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  35.64 
 
 		 106 aa  50.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.05 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1282 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  36.76 
 
 		 416 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.06 
 
 		 1432 aa  49.3  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  19.49 
 
 		 836 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  36.59 
 
 		 792 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1233 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  35.06 
 
 		 1189 aa  46.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1339 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.21 
 
 		 929 aa  45.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  20.39 
 
 		 1256 aa  45.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  25.3 
 
 		 423 aa  45.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1209 aa  45.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1319 aa  45.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  37.31 
 
 		 1222 aa  44.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>