49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4773 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  100 
 
 		 669 aa  1380    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  62.77 
 
 		 647 aa  855    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  66.31 
 
 		 656 aa  924    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  66.72 
 
 		 663 aa  891    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  50.46 
 
 		 722 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  45.45 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  44.67 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  37.31 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  36.22 
 
 		 509 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.02 
 
 		 491 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  32.78 
 
 		 502 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  57.65 
 
 		 180 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  59.09 
 
 		 129 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1010 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  24.58 
 
 		 920 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  50.56 
 
 		 457 aa  96.3  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  38.89 
 
 		 106 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  32.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.6 
 
 		 377 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28.12 
 
 		 466 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  24.04 
 
 		 941 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  22.66 
 
 		 1142 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 101 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  37.18 
 
 		 131 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 131 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.75 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  31.43 
 
 		 909 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 101 aa  47.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30 
 
 		 1151 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 101 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.32 
 
 		 379 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  25.67 
 
 		 430 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  25.67 
 
 		 430 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 430 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 229 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.88 
 
 		 391 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.49 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  34.15 
 
 		 208 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  26.75 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 105 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  25.7 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  31.43 
 
 		 918 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  29.3 
 
 		 363 aa  44.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 101 aa  44.3  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  23.59 
 
 		 430 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  32.05 
 
 		 104 aa  43.9  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 249 aa  43.9  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>