More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4743 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  85.14 
 
 		 272 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  72.4 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  68.22 
 
 		 274 aa  345  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  67.4 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  60.76 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  62.82 
 
 		 241 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 281 aa  299  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  53.7 
 
 		 313 aa  295  4e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  53.99 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 252 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  53.12 
 
 		 253 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  58.56 
 
 		 255 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  58.64 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  56.31 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  50.59 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  48.05 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  46.52 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  51.09 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  46.01 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  47.67 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  45.49 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  45.63 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  48.5 
 
 		 344 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  46.95 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  51.64 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  49.35 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  51.11 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  52.23 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  46.93 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  49.35 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 295 aa  248  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  47.17 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0350  30S ribosomal protein S2  48.26 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.20969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0389  30S ribosomal protein S2  48.26 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0342077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  45.26 
 
 		 282 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  52 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 244 aa  248  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  48.47 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  49 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  44.48 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  50.61 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  49.78 
 
 		 310 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  52.4 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  50.45 
 
 		 244 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  45.86 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  48.26 
 
 		 258 aa  244  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  48.47 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  51.61 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  45.53 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1863  Ribosomal protein S2-like protein  50 
 
 		 317 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  48.47 
 
 		 257 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  45.85 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  45.78 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  48.03 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  44.14 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  51.11 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  48.36 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  48.36 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  45.68 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  46.34 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1483  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1159  ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 246 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0403  30S ribosomal protein S2  48.47 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000078779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0563  SSU ribosomal protein S2P  51.38 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  45.72 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  50.44 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  41.79 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  45.22 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  45.82 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>