16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4724 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  876    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  35.06 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  30.5 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.68 
 
 		 392 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  34.82 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  27.55 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  27.85 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  25.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  32.22 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  26.88 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  35.51 
 
 		 517 aa  53.5  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  25.58 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  26.88 
 
 		 503 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  33 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  29.17 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.3 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>