174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4691 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
323 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  35.26 
 
 
359 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 
346 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
361 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
354 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
313 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
333 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.33 
 
 
343 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  30.92 
 
 
843 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
330 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  31.27 
 
 
327 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  31.27 
 
 
328 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  30.65 
 
 
327 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
339 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  30.48 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  30.65 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  29.79 
 
 
344 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  32.19 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  32.19 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
341 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.91 
 
 
355 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  30.98 
 
 
328 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  26.76 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  32.19 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.19 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  29.31 
 
 
332 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
347 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
346 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
351 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
329 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
328 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.34 
 
 
389 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  26.23 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  27.3 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
368 aa  79  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.29 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.6 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  25.4 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  24.31 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  24.84 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  27.24 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  22.87 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  25.82 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.65 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  42.47 
 
 
647 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  42.47 
 
 
647 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.99 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  21.04 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  39.74 
 
 
421 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  40.62 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  19.64 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.08 
 
 
645 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  37.84 
 
 
496 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  43.75 
 
 
415 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  40 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  43.08 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.42 
 
 
456 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  40.54 
 
 
450 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  40.54 
 
 
450 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  25.58 
 
 
539 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  28.19 
 
 
541 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  48.15 
 
 
445 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  40.3 
 
 
394 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  27.4 
 
 
550 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  35.94 
 
 
451 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  38.16 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  19.43 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  42.42 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  41.67 
 
 
439 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  38.46 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  38.16 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  23.16 
 
 
456 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  35.62 
 
 
647 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  24.24 
 
 
540 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
548 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  20.92 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  27.78 
 
 
539 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 
471 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  27.78 
 
 
539 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  27.78 
 
 
539 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  36.92 
 
 
468 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  47.17 
 
 
436 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>