More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4589 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  83.84 
 
 		 229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  84.89 
 
 		 225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  69.72 
 
 		 219 aa  315  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  60.81 
 
 		 230 aa  294  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 226 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  59.38 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  57.14 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  58.3 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  55.86 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  56.16 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  58.45 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  54.55 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  54.05 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 237 aa  251  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.58 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.94 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  53.42 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.14 
 
 		 230 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.58 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  53.92 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.83 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  54.09 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  52.97 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  50.46 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.32 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.77 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.2 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0024  ABC transporter related  50.91 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  51.14 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  49.77 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  50.68 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  50.68 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  50.68 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  50.68 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  50.68 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  50.23 
 
 		 253 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  50.23 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  49.32 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.98 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  50 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.64 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50.23 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.15 
 
 		 244 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 228 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.91 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.17 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.87 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  48.86 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  51.17 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  47.06 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.75 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.86 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.22 
 
 		 657 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.2 
 
 		 653 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.29 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47.95 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  49.77 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  48.62 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  45.5 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  48.86 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.96 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.51 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  52.48 
 
 		 211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 238 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  46.4 
 
 		 240 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.53 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.08 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.08 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  48.87 
 
 		 671 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.06 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.79 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>