More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4546 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  71.68 
 
 		 230 aa  347  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.36 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.04 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.05 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.95 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.44 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  44.14 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  39.83 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.19 
 
 		 642 aa  192  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.67 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 319 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  43.78 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.71 
 
 		 642 aa  190  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 408 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.12 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40.54 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.99 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.69 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  41.99 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.52 
 
 		 647 aa  187  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.95 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  42.73 
 
 		 653 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  40.64 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.84 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.18 
 
 		 649 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.89 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  40.36 
 
 		 654 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  40 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  45.45 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.41 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.67 
 
 		 665 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  44.39 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.78 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.7 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.58 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 		 649 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  42.4 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.29 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  41.33 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  42.27 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  44.08 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  43.84 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  41.2 
 
 		 665 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 235 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  42.99 
 
 		 660 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  40 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  46.41 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  42.08 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  42.47 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  43.72 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.59 
 
 		 648 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.59 
 
 		 648 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  43.18 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  41.67 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  40.28 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  43.18 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.59 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.72 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  40.45 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  42.36 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  42.33 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.59 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.59 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  42.52 
 
 		 668 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  42.52 
 
 		 668 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.72 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>