More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4534 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1605    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 757 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 711 aa  289  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 705 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 684 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  23.03 
 
 		 670 aa  160  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 702 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 735 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  23.39 
 
 		 725 aa  147  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 781 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 708 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 701 aa  124  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 694 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.44 
 
 		 705 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.76 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 769 aa  97.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 702 aa  94  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1896  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  19.18 
 
 		 687 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 675 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 760 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 730 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  21.6 
 
 		 762 aa  88.6  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 861 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 958 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 701 aa  85.5  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  21.61 
 
 		 623 aa  84.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 824 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 780 aa  81.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  20.42 
 
 		 728 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.72 
 
 		 716 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  32.26 
 
 		 633 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 866 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  22.9 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  19.86 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 770 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.67 
 
 		 690 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1027 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 761 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 710 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1082 aa  77.4  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 735 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 854 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 728 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 971 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.53 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 770 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.25 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1047 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  21.42 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1137 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1027 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 776 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 696 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.55 
 
 		 750 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 893 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  21.84 
 
 		 710 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1116 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28.84 
 
 		 848 aa  72  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 687 aa  72  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.93 
 
 		 630 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.93 
 
 		 630 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  21.81 
 
 		 718 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.96 
 
 		 710 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1021 aa  71.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  28.74 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  28.74 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>