More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4532 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  47.36 
 
 		 846 aa  746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 813 aa  1656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  61.55 
 
 		 807 aa  1001    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  46.36 
 
 		 798 aa  688    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 821 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 736 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 739 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.73 
 
 		 782 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 782 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 774 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 696 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.04 
 
 		 774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 693 aa  121  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 687 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 711 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.48 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 710 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.25 
 
 		 774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.48 
 
 		 784 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.25 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.25 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 782 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 774 aa  111  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 703 aa  108  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 708 aa  107  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.07 
 
 		 784 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.63 
 
 		 712 aa  99.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  22.16 
 
 		 731 aa  99  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.67 
 
 		 717 aa  97.8  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.52 
 
 		 690 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 807 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 688 aa  88.6  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.56 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 809 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  21.85 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.59 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 726 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.43 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 621 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  21.2 
 
 		 789 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  21.5 
 
 		 731 aa  71.6  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 705 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  31.13 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 769 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 793 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  20.06 
 
 		 711 aa  63.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  22.57 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 727 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 770 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 720 aa  60.1  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 727 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.78 
 
 		 762 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  20.93 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  21.61 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  21.46 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  20.19 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.42 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 698 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 936 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 718 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.88 
 
 		 653 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 789 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  19.89 
 
 		 738 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>