111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4497 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  47.65 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  29.37 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  39.84 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  31.34 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  37.76 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  29.55 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  34.41 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  35.65 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  29.73 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  34.68 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  38.2 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  38.2 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  37.08 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  35.96 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  38.89 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  39.02 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  37.8 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  32.53 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  34.88 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.61 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  36.62 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  30.59 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  43.59 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  24 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  35.53 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  30.77 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  33.72 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  28.69 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  32.58 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  39.66 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  25.41 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  32.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  38.64 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  39.22 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  42 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  37.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  36.54 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  32.71 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  33.82 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  35.94 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  36.23 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  30.65 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  36.59 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  44.9 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  34 
 
 		 132 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  42.11 
 
 		 386 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  45 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  34.78 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  40.43 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  27.63 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  34.85 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  37.74 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  36.17 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  35.85 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  39.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  41.46 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>