More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4480 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  84.91 
 
 
232 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  76.29 
 
 
232 aa  374  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  71.98 
 
 
232 aa  349  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  71.18 
 
 
232 aa  343  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  72.44 
 
 
229 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 
232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  69.78 
 
 
232 aa  328  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  70.74 
 
 
229 aa  324  7e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  64.25 
 
 
229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  66.22 
 
 
229 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  61.64 
 
 
229 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  62.25 
 
 
236 aa  278  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  61.99 
 
 
229 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  60.63 
 
 
229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
231 aa  270  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  54.67 
 
 
233 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
230 aa  265  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
230 aa  265  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 
229 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
234 aa  263  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
234 aa  263  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 
233 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
231 aa  260  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.36 
 
 
235 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 
229 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 
233 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  55.31 
 
 
236 aa  258  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
235 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 
235 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  54.22 
 
 
235 aa  256  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 
229 aa  255  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 
230 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 
233 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 
235 aa  254  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  54.67 
 
 
234 aa  254  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.96 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.16 
 
 
232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 
233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.78 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  51.53 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  50.66 
 
 
235 aa  251  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 
230 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  53.98 
 
 
238 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.36 
 
 
225 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 
236 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 
230 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4558  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 
231 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759483  normal  0.0544864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 
231 aa  248  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0616  ribosomal protein L1  55.46 
 
 
231 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  53.33 
 
 
235 aa  248  8e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0827  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
231 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0116287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  51.3 
 
 
237 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  50.22 
 
 
233 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  52.65 
 
 
238 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 
233 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08730  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
231 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  49.79 
 
 
242 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3919  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 
231 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.1 
 
 
236 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4759  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 
231 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00425214  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  49.33 
 
 
241 aa  245  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  48.47 
 
 
233 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 
233 aa  245  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  49.13 
 
 
232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 
234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 
230 aa  244  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.89 
 
 
235 aa  244  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  54.67 
 
 
232 aa  244  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 
237 aa  243  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  50.22 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 
229 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  51.11 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.56 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  56 
 
 
229 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1063  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 
231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0602308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 
234 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 
234 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  51.56 
 
 
239 aa  241  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  48.7 
 
 
231 aa  241  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 
232 aa  241  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>