More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4411 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 537 aa  1076    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.09 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.61 
 
 		 513 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.33 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.24 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.83 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.21 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.87 
 
 		 537 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.8 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.24 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.91 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.08 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.33 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 537 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 521 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.59 
 
 		 517 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 		 532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 529 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.1 
 
 		 511 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.26 
 
 		 530 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 		 529 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 519 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.03 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 525 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.5 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 530 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  35.26 
 
 		 561 aa  301  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 524 aa  300  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 530 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 		 522 aa  297  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
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NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 531 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  33.92 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.54 
 
 		 520 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 554 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 527 aa  292  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.25 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.88 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  34.5 
 
 		 512 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  34.5 
 
 		 512 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  34.3 
 
 		 512 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  34.3 
 
 		 512 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 536 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.06 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.06 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.06 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 537 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 520 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.22 
 
 		 512 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 518 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 508 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 511 aa  286  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 512 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 544 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  34.11 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 515 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  33.91 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 532 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
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