More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4398 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  100 
 
 		 475 aa  968    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  48.82 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  35.57 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  33.41 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  29.81 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  29.02 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  30.66 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  30.68 
 
 		 429 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  28.32 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  28.45 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  26.68 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  26.56 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.81 
 
 		 394 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  28.26 
 
 		 503 aa  126  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  27.02 
 
 		 503 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  29.67 
 
 		 516 aa  123  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  25.34 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  24.28 
 
 		 465 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  29.78 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  27.88 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.2 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.81 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.5 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.23 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.52 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  23.52 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.52 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.29 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  22.99 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  25.42 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  30.54 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.03 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.27 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.86 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.86 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  30.71 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  31.88 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  30.71 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  32.31 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.26 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.76 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.53 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.6 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  28.57 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25.6 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.24 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  29.84 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  29.34 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  20.76 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25.73 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.18 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  33.59 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  32.61 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  34.62 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.16 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  28.48 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  25.7 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  23.64 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  31.25 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.57 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  30.37 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  30.43 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  31.54 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  32.2 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  31.45 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  28.91 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  28.36 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  35.29 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  28.42 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.86 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  29.41 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.86 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  29.71 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  27.36 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  26.61 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.92 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.04 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.92 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  32.56 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  37 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.86 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.39 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  34.78 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.92 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  29.13 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  28.44 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  28.14 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  31.3 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  34.38 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  30.16 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  30.08 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  31.54 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  30.53 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  30.08 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  29.6 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  30.16 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>