More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4383 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  829    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  35.48 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 429 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 426 aa  236  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 431 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 441 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  32.43 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 449 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  31.7 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.52 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  32.04 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  31.8 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  31.8 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  31.8 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  31.8 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.37 
 
 		 448 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  30.56 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  31.81 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  30.03 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  30.03 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  27.65 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  27.65 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  28.88 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  28.13 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  28.88 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  27.65 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  27.43 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  30.07 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  27.42 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  27.42 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  29.49 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  31.55 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  29.24 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>