More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4364 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
294 aa  613  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0721  glycosyl transferase family 2  49.15 
 
 
297 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315795  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
318 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1239  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
308 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0419  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
292 aa  115  8e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2753  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
303 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4831  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
294 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.83 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
328 aa  84.3  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
337 aa  84.7  2e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
336 aa  83.6  3e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
291 aa  83.2  5e-15  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
1162 aa  81.6  1e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
311 aa  81.6  1e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
302 aa  82  1e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
317 aa  82  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.95 
 
 
283 aa  81.6  2e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
722 aa  80.9  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
346 aa  80.5  3e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.0329e-13 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
785 aa  80.5  3e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
334 aa  80.1  4e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
282 aa  79.3  6e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
1268 aa  79.3  6e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
455 aa  79.7  6e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2725  putative glucosyltransferase  28.32 
 
 
302 aa  79.3  7e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.89 
 
 
2401 aa  78.6  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
319 aa  77  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
280 aa  76.3  6e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
312 aa  75.9  8e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
841 aa  75.1  1e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.7 
 
 
700 aa  74.7  2e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
312 aa  74.3  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
270 aa  74.3  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
324 aa  73.9  3e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
308 aa  73.6  4e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
302 aa  72.8  6e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
369 aa  72.8  6e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
321 aa  72.8  7e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
624 aa  72.4  7e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
290 aa  72.4  9e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
1739 aa  72  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
296 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
729 aa  71.6  1e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
322 aa  72  1e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
296 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
296 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
1077 aa  71.2  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
303 aa  71.2  2e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
279 aa  70.9  2e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
679 aa  70.5  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
1523 aa  70.9  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
297 aa  70.5  3e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  27.16 
 
 
301 aa  70.1  5e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
305 aa  69.3  7e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
346 aa  68.9  9e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
415 aa  68.6  1e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
616 aa  68.6  1e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
306 aa  68.2  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
307 aa  67.8  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
329 aa  67.8  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
288 aa  67.8  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
307 aa  67.8  2e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  26.51 
 
 
312 aa  67.4  3e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
311 aa  67.4  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
1523 aa  67  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
841 aa  67  4e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
322 aa  67  4e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
313 aa  66.6  5e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 
832 aa  66.2  6e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
703 aa  66.2  6e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
284 aa  65.9  8e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
330 aa  65.9  9e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
581 aa  65.1  1e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.74352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
231 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
1152 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.57 
 
 
1182 aa  65.1  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
1509 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
1152 aa  64.7  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
300 aa  63.9  3e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
299 aa  63.9  3e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
340 aa  63.9  3e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
528 aa  63.9  3e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
305 aa  63.9  3e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.61 
 
 
292 aa  63.5  4e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
330 aa  63.2  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
625 aa  63.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
305 aa  63.2  6e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
315 aa  62.8  6e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
334 aa  63.2  6e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
748 aa  62.8  7e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
270 aa  62.8  7e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>