48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4154 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  100 
 
 
279 aa  567  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  39.35 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  34.18 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  33.7 
 
 
274 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  36.33 
 
 
269 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  33.82 
 
 
273 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  33.57 
 
 
269 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  38.32 
 
 
281 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  34.89 
 
 
284 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  32.73 
 
 
273 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  34.42 
 
 
284 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  34.78 
 
 
269 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  32.85 
 
 
287 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  32.85 
 
 
297 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  32.01 
 
 
278 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  31.25 
 
 
294 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  32.48 
 
 
287 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  33.58 
 
 
280 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  32.35 
 
 
288 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  30.8 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  30.8 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  31.77 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  31.75 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  30.8 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  30.22 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  31.23 
 
 
289 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  32.73 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  32.85 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  28.51 
 
 
611 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  28.79 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  27.08 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  29.84 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  25.23 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  28.12 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  27.08 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  25.23 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  25.95 
 
 
348 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  25.33 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  27.72 
 
 
559 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  28.92 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  23.53 
 
 
587 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  29.26 
 
 
229 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  26.28 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  25.97 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  26.51 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  23.94 
 
 
418 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  23.74 
 
 
234 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  28.7 
 
 
221 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>