102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4132 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  35.48 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  36.03 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  30.94 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30.34 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  29.66 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  32.45 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  29.63 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  28.05 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  31.13 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  31.16 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  27.95 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  31.06 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  30.3 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  32.77 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  29.14 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.43 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  27.21 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  26.81 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  29.87 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  30.07 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  28.48 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  28.35 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  30.08 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  28.35 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  30.5 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  30.66 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  30.23 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  27.82 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  26.87 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  27.14 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  28.93 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  28.93 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  28.89 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  28.89 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  27.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  25 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  30.07 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  29.93 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  28.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  30.07 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.53 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  26.87 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  30.47 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  26.71 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.69 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  27.85 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2644  hypothetical protein  29.79 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0713606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.76 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  26.52 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  26.24 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  22.15 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  26.88 
 
 		 318 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  25 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  23.94 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  26.47 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  26.88 
 
 		 322 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  25.17 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  25.36 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  23.24 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.57 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  26.12 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  32.88 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3547  outer membrane protein  23.9 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00647416  normal  0.0413826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0083  hypothetical protein  31.71 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0959336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  24.86 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  29.13 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  26.06 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  23.48 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3054  hypothetical protein  21.64 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000764336  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  23.36 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  26.45 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  24.81 
 
 		 178 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>