57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4129 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1453    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.08 
 
 		 681 aa  352  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  29.85 
 
 		 676 aa  253  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  26.89 
 
 		 494 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  25.67 
 
 		 654 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  27.52 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.28 
 
 		 672 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  24.85 
 
 		 697 aa  110  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  30.22 
 
 		 654 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.59 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  21.69 
 
 		 670 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  29.44 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.84 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  37.23 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.29 
 
 		 640 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  29.25 
 
 		 976 aa  51.2  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  36.99 
 
 		 442 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  28.42 
 
 		 597 aa  51.2  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  30.05 
 
 		 496 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  21.33 
 
 		 668 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  22.7 
 
 		 660 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  41.51 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.14 
 
 		 464 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  31.15 
 
 		 418 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.67 
 
 		 429 aa  48.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  40.74 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.09 
 
 		 437 aa  47.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.86 
 
 		 595 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  29.03 
 
 		 449 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.65 
 
 		 591 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  40.85 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  41.1 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  40.74 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.3 
 
 		 652 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  38.46 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  35.21 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.47 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  33.33 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  38.36 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  47.17 
 
 		 478 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.09 
 
 		 482 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  31.37 
 
 		 513 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 642 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.21 
 
 		 613 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.25 
 
 		 616 aa  44.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  46.81 
 
 		 427 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  43.55 
 
 		 439 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.77 
 
 		 579 aa  44.3  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.31 
 
 		 607 aa  44.3  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  50 
 
 		 604 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 497 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  42.86 
 
 		 577 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.86 
 
 		 496 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  27.74 
 
 		 423 aa  43.9  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>