More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4120 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 466 aa  959    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  50.34 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  48.11 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  46.95 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  47.21 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  45.41 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  42.44 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  40.67 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  39.78 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  40.43 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.89 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  39.21 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  40.7 
 
 		 787 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  41.86 
 
 		 744 aa  210  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  40.58 
 
 		 689 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  41.8 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  42.75 
 
 		 653 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.42 
 
 		 657 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  41.98 
 
 		 652 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  41.34 
 
 		 619 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.21 
 
 		 656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  43.13 
 
 		 656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  41.52 
 
 		 665 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 680 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  35.88 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 		 1085 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.06 
 
 		 1193 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  39.48 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 		 697 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  41.06 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.25 
 
 		 639 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  40.08 
 
 		 788 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  37.21 
 
 		 749 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  38.67 
 
 		 682 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  41.63 
 
 		 725 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 662 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  38.58 
 
 		 646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 		 671 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  38.78 
 
 		 634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 725 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  36.5 
 
 		 622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  35.55 
 
 		 698 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  36.58 
 
 		 687 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  38.74 
 
 		 678 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  40.39 
 
 		 697 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  52 
 
 		 134 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.89 
 
 		 577 aa  133  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  34.63 
 
 		 570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  36.41 
 
 		 578 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  34.95 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  34.95 
 
 		 570 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  34.95 
 
 		 570 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  35.52 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  30.93 
 
 		 299 aa  123  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  36.32 
 
 		 617 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.68 
 
 		 580 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  34.27 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  34.94 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  33.18 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  33.48 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.67 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  34.22 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  33.7 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  34.84 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 		 387 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  31.93 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  34.03 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  33.19 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  32.5 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  30.28 
 
 		 628 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.48 
 
 		 804 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  34.14 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  33.47 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.85 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  35.55 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.49 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  34.14 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.47 
 
 		 701 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.63 
 
 		 810 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.33 
 
 		 737 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.5 
 
 		 806 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  34.45 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  35.43 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  33.2 
 
 		 400 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  31.93 
 
 		 390 aa  103  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.9 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  36.9 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.54 
 
 		 631 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  33.95 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.38 
 
 		 769 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30.19 
 
 		 810 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  32.66 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.63 
 
 		 805 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.53 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  33.73 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>