More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4060 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
334 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3374  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.36 
 
 
335 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 
335 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.35 
 
 
322 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.48 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.5 
 
 
330 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.07 
 
 
326 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  40.72 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  41.59 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.71 
 
 
331 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1047  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.62 
 
 
328 aa  259  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12483  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
320 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  39.63 
 
 
326 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.45 
 
 
326 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  39.33 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.33 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.33 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1536  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.38 
 
 
328 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1567  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.38 
 
 
328 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.72 
 
 
329 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.45 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.02 
 
 
326 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.02 
 
 
326 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.33 
 
 
326 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.14 
 
 
326 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.25 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.45 
 
 
330 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2331  HI0933-like protein protein  42.24 
 
 
338 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.24 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.34 
 
 
840 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0149  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0178346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.52 
 
 
455 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  29.62 
 
 
304 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  29.47 
 
 
317 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  26.01 
 
 
811 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  30 
 
 
313 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  29.94 
 
 
323 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1947  oxidoreductase  28.81 
 
 
317 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00745664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  31.83 
 
 
409 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  30.1 
 
 
318 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  29.87 
 
 
321 aa  99  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  29.34 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  31.43 
 
 
318 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  30.42 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.25 
 
 
438 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  30.03 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 
547 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  28.8 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  28.25 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  29.43 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  29.7 
 
 
310 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  28.39 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  27.9 
 
 
550 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  29.34 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  31.08 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  28.9 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  26.64 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  28.57 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  30.13 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  29.9 
 
 
317 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  29.26 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  29.22 
 
 
321 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  27.13 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  29.26 
 
 
306 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  27.3 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.9 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  29.8 
 
 
310 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  29.71 
 
 
320 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.21 
 
 
300 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  28.48 
 
 
311 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.61 
 
 
548 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  28.43 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  29.77 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  28.81 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  29.32 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  27.81 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  27.01 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  28.06 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  29.53 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.95 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  27.39 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  28.62 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  29.26 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  28.28 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  29.36 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  27.42 
 
 
318 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  27.42 
 
 
318 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  27.42 
 
 
321 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.42 
 
 
321 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.42 
 
 
321 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  28.66 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  27.42 
 
 
318 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  27.42 
 
 
318 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  28.43 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  28.57 
 
 
311 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  31.28 
 
 
323 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  30.23 
 
 
309 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  28.39 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.86 
 
 
858 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  27.42 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>