58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3977 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  60.07 
 
 
593 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
593 aa  1222    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  55.11 
 
 
368 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  40.81 
 
 
321 aa  170  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  35.03 
 
 
362 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  30.8 
 
 
479 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 
262 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  30.84 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 
260 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  27.93 
 
 
368 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  32.02 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  34.47 
 
 
1072 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.34 
 
 
221 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  31.19 
 
 
268 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  30.58 
 
 
249 aa  94  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  27.23 
 
 
648 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  25.39 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  25.73 
 
 
236 aa  76.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  27.67 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.03 
 
 
424 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  25.94 
 
 
348 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  27.81 
 
 
422 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  27.82 
 
 
372 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  29.73 
 
 
280 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.84 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  28.78 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  24.63 
 
 
274 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  26.23 
 
 
261 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  28.35 
 
 
246 aa  53.9  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
261 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  29.29 
 
 
681 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  26.85 
 
 
386 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  26.14 
 
 
338 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
358 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  30.89 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  25.67 
 
 
217 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  26.32 
 
 
255 aa  50.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.2 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  22.34 
 
 
341 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 
257 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  27.05 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  28.36 
 
 
522 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  27.71 
 
 
230 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
378 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  22.09 
 
 
342 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  30.89 
 
 
402 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0700  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  23.4 
 
 
196 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  23.27 
 
 
392 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  22.97 
 
 
228 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0603  GDSL family lipase  33.11 
 
 
199 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  0.0431523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  24.28 
 
 
340 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  27.51 
 
 
233 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  23.33 
 
 
338 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  24.64 
 
 
394 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  29.73 
 
 
401 aa  43.9  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3012  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.53 
 
 
417 aa  43.9  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>