More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3939 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 141 aa  295  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.59 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.85 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.58 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.7 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  59.42 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.03 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.29 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.08 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  44.76 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  55.74 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  49.62 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  49.26 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.46 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  45 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  50.36 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  44.96 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  48.48 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  47.73 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  47.52 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.04 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  45.04 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  48.44 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  45.59 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  44.19 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.88 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  46.83 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  49.58 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  46.77 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  45.74 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  49.59 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 255 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.22 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  41.09 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.99 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  41.09 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  41.09 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  41.09 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  41.09 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  39.53 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 258 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  39.53 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.92 
 
 		 287 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  39.53 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.8 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  39.53 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.78 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 254 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.12 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  38.93 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  38.93 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  38.76 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  44.35 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  43.7 
 
 		 254 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  41.6 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  42.36 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.18 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.97 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 168 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  40 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  40 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  40 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  40 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  40 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>