More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3923 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 557 aa  1137    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  72.64 
 
 		 550 aa  834    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  54.95 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  43.3 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  43.1 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  41.59 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  42.44 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  37.55 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  34.83 
 
 		 572 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 		 563 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.27 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  34.33 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.79 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  34 
 
 		 538 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  32.67 
 
 		 556 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  31.21 
 
 		 842 aa  222  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  31.97 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  32.64 
 
 		 567 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  30.48 
 
 		 507 aa  207  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  31.62 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  33.62 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  32.99 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  30.72 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 		 575 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  33.61 
 
 		 439 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.9 
 
 		 434 aa  200  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.98 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.57 
 
 		 419 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 		 455 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  31.89 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 		 445 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 379 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  33.7 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 		 483 aa  197  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  33.33 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  32.03 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  32.03 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  33.92 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  33.78 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  33.78 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  31.73 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  32.43 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 		 525 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  34.14 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  33.75 
 
 		 441 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 		 400 aa  194  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  31.75 
 
 		 532 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  34.42 
 
 		 480 aa  193  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  29.54 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  33.74 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  30.37 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 457 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  32.12 
 
 		 444 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.28 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  31.18 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 442 aa  191  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.93 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.93 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  32.63 
 
 		 448 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 		 448 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  32.93 
 
 		 456 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  32.45 
 
 		 535 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  33.23 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  31.55 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  33.42 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  30.05 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  32.15 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  29.75 
 
 		 476 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 		 444 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>