199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3893 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
760 aa  1572    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.61 
 
 
765 aa  896    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.34 
 
 
790 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.86 
 
 
766 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 
795 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.13 
 
 
618 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.14 
 
 
762 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.5 
 
 
605 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.55 
 
 
613 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.66 
 
 
609 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.45 
 
 
772 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  34.75 
 
 
795 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.61 
 
 
526 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.62 
 
 
634 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.28 
 
 
553 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  37 
 
 
779 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.95 
 
 
905 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  33.03 
 
 
777 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.87 
 
 
775 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.42 
 
 
774 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.18 
 
 
533 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.94 
 
 
779 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.11 
 
 
542 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.66 
 
 
781 aa  353  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 
613 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.56 
 
 
776 aa  347  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.96 
 
 
655 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.73 
 
 
534 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  41 
 
 
549 aa  338  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.63 
 
 
618 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.01 
 
 
527 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 
736 aa  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.87 
 
 
821 aa  320  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.23 
 
 
812 aa  320  9e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.07 
 
 
812 aa  319  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.99 
 
 
785 aa  317  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 
505 aa  316  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.8 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.84 
 
 
534 aa  311  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
546 aa  310  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  37.05 
 
 
637 aa  303  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.1 
 
 
639 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.78 
 
 
529 aa  297  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.97 
 
 
469 aa  296  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  35.48 
 
 
602 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 
834 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
665 aa  283  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.73 
 
 
543 aa  282  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
628 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 
547 aa  281  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
525 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 
549 aa  277  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.64 
 
 
545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.88 
 
 
858 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.19 
 
 
614 aa  262  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
422 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.27 
 
 
481 aa  259  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
515 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
627 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.09 
 
 
636 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 
558 aa  247  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.84 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.93 
 
 
584 aa  244  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 
688 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
639 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.61 
 
 
816 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.39 
 
 
525 aa  241  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
688 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 
447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.53 
 
 
852 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.79 
 
 
528 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 
683 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
636 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 
533 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 
863 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.78 
 
 
639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  30.07 
 
 
889 aa  221  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.76 
 
 
866 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.33 
 
 
493 aa  214  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.82 
 
 
500 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.76 
 
 
868 aa  210  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
504 aa  210  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.44 
 
 
1140 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
673 aa  208  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 
673 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
913 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 
794 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
807 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 
857 aa  204  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.14 
 
 
913 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
910 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.65 
 
 
676 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
888 aa  200  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 
915 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  27.17 
 
 
896 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
820 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 
853 aa  197  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 
797 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 
518 aa  195  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.22 
 
 
896 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>