87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3891 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  52.53 
 
 		 302 aa  325  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  34.62 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  36.51 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  36.9 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  31.75 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  29.76 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  32.16 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  33.62 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  31.06 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  27.31 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.57 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.15 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.69 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  28.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.94 
 
 		 795 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.31 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.94 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.65 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  29.76 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.49 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.79 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  31.54 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  25.89 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  27.75 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  26.61 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.89 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.22 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.92 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  28.68 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  27.71 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  26.16 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.8 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.87 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  25.24 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.71 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.3 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  25.31 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.49 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.47 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.89 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.08 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  25.67 
 
 		 396 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  26.32 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  26.39 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  31.61 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  23.95 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25.9 
 
 		 563 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  28.8 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  25.11 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  21.3 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  24.9 
 
 		 656 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.19 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  27.03 
 
 		 423 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1281  phospholipase/Carboxylesterase  27.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.06 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  23.29 
 
 		 544 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  26.71 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  20.9 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  29.41 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  23.97 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.79 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  23.65 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  23.38 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  25.34 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.33 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  30 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  26.37 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  20.88 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  30.25 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  22.9 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  25.86 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.14 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.83 
 
 		 1002 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  22.03 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  24.43 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  26.18 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  27.1 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  24.32 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.38 
 
 		 451 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  25 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>